Gene expression prediction on HestBench benchmark leaderboard · SOTA2 Research

Gene expression prediction on HestBench

0.655IDC ScoreMINT

Evaluation Results

Method	Links
MINT2026.03		0.655	0.389	0.509	0.695	0.314	0.244	0.283	0.597	0.275	0.44
H-optimus-02026.03		0.598	0.385	0.493	0.643	0.299	0.229	0.265	0.558	0.26	0.415
Virchow2 + SEAL2026.02		0.596	0.361	0.487	0.632	0.269	0.202	0.277	0.569	0.261	0.406
Virchow22026.02		0.595	0.353	0.476	0.643	0.258	0.199	0.27	0.573	0.258	0.4028
H0mini + SEAL2026.02		0.592	0.384	0.509	0.608	0.301	0.198	0.265	0.559	0.266	0.4091
Virchow22026.03		0.592	0.347	0.466	0.617	0.258	0.208	0.279	0.561	0.258	0.398
H0mini2026.02		0.59	0.359	0.505	0.619	0.263	0.203	0.264	0.565	0.265	0.4037
Univ22026.02		0.59	0.357	0.5	0.661	0.302	0.222	0.264	0.559	0.273	0.4142
UNI2-h2026.03		0.59	0.357	0.5	0.66	0.301	0.223	0.264	0.558	0.273	0.414
H0-mini2026.03		0.586	0.368	0.492	0.601	0.249	0.186	0.267	0.548	0.263	0.396
Univ2 + SEAL2026.02		0.585	0.365	0.521	0.658	0.319	0.216	0.264	0.573	0.266	0.4186
UNI2026.03		0.57	0.314	0.476	0.625	0.263	0.176	0.243	0.551	0.257	0.386
Virchow2026.03		0.57	0.331	0.488	0.609	0.311	0.202	0.264	0.546	0.259	0.398
Gigapath + SEAL2026.02		0.564	0.348	0.488	0.579	0.294	0.2	0.261	0.543	0.259	0.3929
Gigapath2026.02		0.552	0.376	0.477	0.557	0.3	0.191	0.241	0.543	0.25	0.3874
GigaPath2026.03		0.551	0.371	0.477	0.554	0.301	0.186	0.239	0.54	0.249	0.385
Conch + SEAL2026.02		0.548	0.367	0.439	0.593	0.285	0.161	0.204	0.534	0.254	0.3761
Conch2026.02		0.544	0.354	0.445	0.603	0.266	0.166	0.205	0.524	0.253	0.3733
CONCH 1.52026.03		0.544	0.381	0.457	0.552	0.28	0.16	0.218	0.551	0.27	0.379
CONCH2026.03		0.536	0.355	0.448	0.579	0.253	0.167	0.218	0.531	0.251	0.371
Phikon2026.03		0.533	0.342	0.443	0.536	0.259	0.152	0.242	0.547	0.237	0.366
REMEDIS2026.03		0.529	0.347	0.464	0.582	0.286	0.115	0.265	0.534	0.247	0.374
CTransPath2026.03		0.511	0.343	0.438	0.511	0.229	0.11	0.228	0.499	0.235	0.345